De prefrontale cortex speelt een belangrijke rol bij het reguleren van emoties, waaronder angst. Het is betrokken bij het verwerken van informatie over bedreigende situaties en het beoordelen van de ernst van de bedreiging. Door de verbindingen met andere hersengebieden, zoals de amygdala en de insula, kan de prefrontale cortex de reacties op angst reguleren en helpen bij het nemen van beslissingen over hoe te reageren op stressvolle situaties. Een disfunctionele prefrontale cortex kan leiden tot een verhoogd risico op angststoornissen en verminderde stressrespons.