Er zijn verschillende oorzaken voor ontstekingen in de mond. De meest voorkomende oorzaak is bacteriële infecties, zoals tandvleesontsteking of een abces in de mond. Andere oorzaken kunnen virale infecties zijn, zoals herpes, of schimmelinfecties, zoals spruw. Ook kan een beschadiging van het mondslijmvlies, bijvoorbeeld door het bijten op de binnenkant van de wang, leiden tot een ontsteking. Bovendien kunnen sommige medicijnen bijwerkingen hebben die leiden tot een ontsteking van het mondslijmvlies. In sommige gevallen kan een ontsteking in de mond ook een symptoom zijn van een onderliggende aandoening, zoals de ziekte van Crohn of lupus.